Le 3 juin 2004, les clubs d’Arcachon et de Gujan-Mestras fusionnent pour former le Football Club Bassin d’Arcachon Sud. En juin 2013, une nouvelle fusion a lieu entre le club du Bassin d’Arcachon Sud et celui de La Teste de Buch pour former le club actuel.

En parallèle à la première fusion, Jean-Pierre Papin commence sa carrière d’entraîneur au club à travers ce projet ambitieux. Il y reste 2 saisons de 2004 à 2006. Sous sa conduite, le club accède pour la première fois de son histoire au CFA2 en 2005 et restera à ce niveau jusqu’en 2010. Il redescend alors en Division d’Honneur pendant trois saisons frôlant la relégation au second échelon régional (DHR) en 2013, avant de remonter en CFA 2 en survolant la saison en 2014 sous la direction de Jean-Pierre L’Eglise. Malheureusement, le retour de Jean-Pierre Papin pour la saison en CFA 2 est un échec et l’équipe fait son retour en Division d’Honneur pour 2015-2016, niveau auquel elle se maintient à la fin de cette saison.

Lors de la saison 2018/2019, les dirigeants choisissent l’ancien attaquant international français Steve Savidan (1 sélection) comme entraîneur. Le FCBA évolue alors en Régional 1 (6ème échelon national). L’équipe termine en tête du championnat au terme d’une dernière journée rocambolesque. Menés 3-0 à la 80ème minute en terrain hostile chez le club de Tartas Saint Yaguen, les joueurs se surpassent et s’imposent 4-3 notamment grâce à un triplé de l’ancien international espoir français Marvin Esor (dont deux sur coup-franc ). Ce jour là, Marmande, Libourne et Arcachon jouaient la montée en N3, mais le FCBA est donc promu pour la saison 2019/2020.

Dernier de la poule A après 8 journées de championnat N3 2019-2020 (1 victoire, 2 matchs nuls, 5 défaites), Steve Savidan est démis de ses fonctions.

Ont suivies deux années covid, durant lesquelles malheureusement, nous avons toutes et tous été impactés.

En juin 2021, le nouveau président, Monsieur WALKOWIAK Jacques, a nommé Marvin Esor entraîneur de l’équipe première.